日本祭祀厕所神的方式因地而异，核心围绕清洁供奉、特定仪式和礼仪禁忌展开。

基础清洁与日常礼仪：这是最普遍的祭祀前提，人们认为厕神爱洁净。福岛地区民众如厕前会敲门并道“早上好”“晚上好”；神奈川县民众不会光着身子如厕，避免冒犯厕神；还有人如厕前清嗓子，防止惊扰传说中持矛的盲厕神。

特定日期供奉祭品：东北地区每年1月15日晚，母亲会熄厕灯、点蜡烛，将长方形年糕供奉在马桶前求家人平安；奥多摩地区1月16日会把厕所擦干净并点燃焚香，避免家人患结膜炎；九州部分地区会把装饰年糕的柳枝或荨麻枝放进厕所，祈求家人远离泌尿系统疾病。

人偶与神龛祭祀：群马县会供奉纸叠的男女人型偶，福冈县以梳辫子的人偶为厕神；宫城县部分家庭设神龛祭祀厕神，还称其为“雛公主”，部分地区会在正月十四或十六日更换厕神的新人偶；新建房屋时，还有人会将人偶埋在马桶下祭祀。

针对性祈福祭祀：石垣岛的病人会用香、花、米饭和米酒供奉厕神祈福；长野县部分地区牙疼患者会向厕神点灯求愈；福岛地区婴儿出生21天，长辈会抱其去邻居家厕所放5元硬币，祈求厕神保佑孩子健康成长。

小众特色祭祀：有些地方年末会给厕所摆新娘装饰，一家人坐在厕所前草席上致意，每人吃一口饭表示领受厕神恩赐；还有地方会在厕所设置小祭坛，摆放鲜花、清水等供品，以此维系与厕神的联结。

日本对厕所神的祭祀时间多集中在正月，还有特定节气、婴儿出生等特殊时刻，部分地区还有专属祭日。

正月核心祭祀时段：东北地区在每年1月15日晚，会用蜡烛和长方形年糕供奉厕神求家人平安；奥多摩地区则在1月16日，清洁厕所后点燃焚香祭祀，避免家人患上结膜炎。

此外，有说法称农村地区会在农历正月初一举行专门的厕神祭祀仪式。

地区专属固定祭日：武州的入间和比企两郡，会把厕所扫把当作与厕神密切相关的产神供奉，分别在3月19日和11月19日献上祭礼。

人生特殊节点祭祀：福岛地区婴儿出生21天，长辈会抱婴儿去邻居家厕所放硬币祈厕神保佑；还有“雪隠参り”习俗，婴儿出生第七天要去厕所参拜厕神，祈求孩子健康结实。

特殊民俗关联时刻：有传说提到除夕夜，若在厕所念诵三次特定咒语可召唤厕神相关的半妖神，不过这更偏向民俗奇谈，并非常规祭祀仪式。

另外11月10日是日本“厕所节”，虽无特定厕神祭祀流程，但这天人们清洁厕所的行为，也暗含对厕神的尊崇之意。